Résumé

Ce projet vise à analyser une partie du déluge de données génomiques qui inonde actuellement les sciences du Vivant. Ces données sont fondamentales pour l’élucidation de nombreuses questions dont celles concernant l’histoire évolutive des gènes, des génomes et des espèces. L’Informatique et les Mathématiques apportent leur arsenal méthodologique pour traiter de telles données. Cependant les approches actuelles sont compartimentées, ce qui limite à la fois leur pertinence et les temps de calculs.

Nous proposons de réaliser un saut quantitatif et qualitatif pour la résolution des questions évoquées ci-dessus. Pour cela nous nous appuierons sur des méthodes utilisant des paradigmes algorithmiques récents, mais aussi sur des modélisations permettant d’intégrer plusieurs types de données. Ces progrès bénéficieront aussi à l’étude des relations entre plantes, parasites et bactéries, domaine avec lequel il existe un parallèle très fort pour certains des problèmes considérés.

Partenaires:

Berry Vincent (resp. projet)
Arigon Anne-Muriel
Paul Christophe
Jean-Philippe Doyon
Thi Hau Nguyen *


Douzery Emmanuel


Caraux Gilles
Ranwez Vincent


Emmanuelle Jousselin
Jean-François Dufayard
Manuel Ruiz


Mathieu Rouard

* PHD financée par le projet coencadrement LIRMM-ISEM

Financement


Webmaster:Vincent Berry, former webmaster: T-H Nguyen