MVE: Méthodes informatiques et modélisation pour le vivant et l'environnement

Ce pôle regroupe les équipes et chercheurs du département informatique travaillant à l’interface des sciences du vivant et de l’environnement. De nombreux domaines sont concernés : algorithmique, optimisation, probabilités et statistiques, bases et fouille de données, représentation des connaissances, traitement et analyse d’images. Les applications couvrent un large spectre : génomique, biologie moléculaire et cellulaire, médecine, agronomie, préservation de la biodiversité. Le pôle est en lien étroit avec le Labex NUMEV et l’Institut de Biologie Computationnelle.

Equipes


Séminaires 2013

Plan d'accès à l' IBC.  Plan d'accès au LIRMM
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31/05/2013, salle 127 à l'IBC, 95 rue de la Galéra, 34095 Montpellier cedex 5
CRAC: an integrated approach to the analysis of RNA-seq reads
Nicolas PHILIPPE, Institut de Recherche en Biothérapie (IRB), Montpellier, France.
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31/05/2013, salle 127 à l'IBC, 95 rue de la Galéra, 34095 Montpellier cedex 5
iPlant SSWAP (Simple Semantic Web Architecture and Protocol) enables semantic pipelines for biodiversity
Dr Damian Gessler, iPlant Collaborative, USA
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24/05/2013, salle 127 à l'IBC, 95 rue de la Galéra, 34095 Montpellier cedex 5
Web Science:  Distributed, Explicit, Transparent, Automated, Reusable, and Reproducible Experiments
Dr Mark Willkinson, Polytechnic University of Madrid, and University of British Columbia
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17/05/2013, salle 127 à l'IBC, 95 rue de la Galéra, 34095 Montpellier cedex 5
Phenomics and data deluge: an Australian experience
Dr Xavier Sirault, The High Resolution Plant Phenomics Centre, CSIRO Plant Industry, Black Mountain, Cnr Clunies Ross Street and Barry Drive, Canberra, ACT 2601, Australia
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17/05/2013, salle 127 à l'IBC, 95 rue de la Galéra, 34095 Montpellier cedex 5
Genomes as documents of evolutionary history
Eric Tannier, INRIA Rhône-Alpes, LBBE, Université de Lyon 1, Lyon, France
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25/03/2013, salle 127 à l'IBC, 95 rue de la Galéra, 34095 Montpellier cedex 5
Big Data Workflows - how provenance can help
Marta Mattoso, UFRJ, Rio de Janeiro, Brazil
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22/03/2013, de 14h à 15h30, salle 127 à l'IBC, 95 rue de la Galéra, 34095 Montpellier cedex 5
Parallel Techniques for Big Data
Patrick Valduriez, Zenith team, INRIA and LIRMM, Montpellier, France
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30/01/2013 à 10h30, salle 127 à l'IBC, 95 rue de la Galéra, 34095 Montpellier cedex 5
Upstart Puzzles
Dennis Shasha, Courant Institute of Mathematics, New York University, USA
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11/01/2013 de 14h à 15h30, salle 127 à l'IBC, 95 rue de la Galéra, 34095 Montpellier cedex 5
Applications of Compressed Data Structures on Sequences and Structured Data
Niko Välimäki, Finnish Centre of Excellence in Cancer Genetics Research

Séminaires 2012

Plan d'accès à l' IBC.  Plan d'accès au LIRMM
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14/12/2012 de 14h à 15h30, salle 127, à l'IBC, 95 rue de la Galéra, 34095 Montpellier cedex 5
Analyse de la diversité génétique et inférence de l'histoire démographique des populations à partir de données de génotypage haut-débit
Mathieu Gautier, INRA, UMR CBGP, Campus International de Baillarguet, 34980 Montferrier sur Lez, France
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06/12/2012 à l'IBC, salle 127, 95 rue de la Galéra, 34095 Montpellier cedex 5
Exploring Provenance in High Performance Scientific Computing
Marta Mattoso, COPPE/UFRJ, Rio de Janeiro, Brazil
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09/11/2012 de 14h à 15h30, à l'IBC, salle 127, 95 rue de la Galéra, 34095 Montpellier cedex 5.
Rice Genomics in the area of Post-Genomics, an Overview of possibilities
François Sabot, IRD,  Equipe Génome et Développement du Riz, UMR DIADE

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12/10/2012 à 14h à l'IBC, salle 127, 95 rue de la Galéra 34095, Montpellier cedex 5.
Anomalies phyllotaxiques : bruit ou ordre caché ? Retour sur les mécanismes fondamentaux de la morphogenèse végétale.
Christophe Godin, Inria - Equipe Virtual Plants, UMR AGAP
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Mots-clés

Bioinformatique, Traitement et analyse des données et des images médicales et biologiques, Modélisation et simulation des systèmes biologiques, Aide à la décision et prospectives environnementales

Dernière mise à jour le 26/06/2013