Responsabilités

Nous nous impliquons dans les comités éditoriaux de 6 revues internationales, de nombreuses conférences d'algorithmique et de bioinformatique. En outre, nous exerçons des responsabilités dans les instances scientifiques telles que le GdR de "Bioinformatique Moléculaire" et les réseaux de plateformes nationales ( France Génomique et Institut Français de Bioinformatique IFB). Au plan local, outre les responsabilités d'enseignement, nous sommes responsables de l'Institut de Biologie Computationnelle, et impliqués dans les conseil de département scientifique de l'Université ou la Plateforme de Bioinformatique ATGC.

Comités éditoriaux de revues - Editorial boads

  1. Systematic Biology (associate editor)
  2. BMC Bioinformatics
  3. BMC Evolutionary Biology
  4. Algorithms for Molecular Biology
  5. Evolutionary Bioinformatics
  6. Dataset Papers in Biology

Comités de sélection de conférences internationales

  1. 24th International Symposium on String Processing and Information Retrieval SPIRE 2017
  2. 28th Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching, CPM 2017
  3. NGS Conference - Structural variation and population genomics 2017
  4. ECCB European Conference on Computational Biology: 2012, 2014, 2016
  5. RECOMB-SEQ RECOMB Satellite Workshop on Massively Parallel Sequencing: 2016
  6. NGS Conference - Genome Annotation: 2016
  7. IEEE BIBM International Conference on Bioinformatics and Biomedicine: 2015-2016
  8. WABI (Workshop on Algorithms in Bioinformatics) 2012-2017
  9. RECOMB-CG (RECOMB Satellite Workshop on Comparative Genomics) 2010-2017
  10. ISMB (International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology) 2015-2016
  11. ACM-BCB (ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedical Informatics) 2016,2013
  12. APBC (Asian Pacific Biocomputing Conference) 2016-2015
  13. 27th Annual Workshop on Mathematical and Statistical Aspects of Molecular Biology, MASAMB 2017

Responsabilités nationales ou internationales

  1. Directeur du GdR de "Bioinformatique Moléculaire" 2010-2015
  2. Président et membre de la Commission Interdisciplinaire du CoNRS : Modélisation des systèmes biologiques, bioinformatique.
  3. Membre du Conseil Scientifique de l’Institut des Sciences de l’Information et leurs Interactions (CSI INS2I)
  4. Membre du Management Committee de l'Action COST "SeqAhead" (2011-2015) (nom complet: Next Generation Sequencing Data Analysis Network), sur la Bioinformatique pour le Séquençage Haut-débit, et responsable des Séjours Jeunes Chercheurs (STSM).
  5. Membre de la Society of Systematic Biology
  6. Co-responsabilité WorkPackage dans le réseau France Génomique depuis 2012
  7. Membre de Executive Board et plateforme fondatrice de l'Institut Français de Bioinformatique (IFB) depuis sa création

Responsabilités et implications régionales

  1. Direction de l'Institut de Biologie Computationnelle 2012-2017
  2. Direction Plateforme de Bioinformatique ATGC depuis 2001
  3. Conseil du Département Scientifique MIPS, de l'université de Montpellier
  4. Labex Numev, membre du comité et co-responsable du Projet Intégré "ADN et génomes" depuis sa création.
  5. Responsable des formations "Bioinformatique pour les NGS" , "Phylogénie" et "Linux et script pour la bioinformatique".
  6. Responsable et co-responsable du Département-Informatique du LIRMM 2007-2010 puis 2012-2014.
  7. Membre du Conseil Scientifique du LIRMM de 2012 à 2014.
  8. Membre du Conseil de Laboratoire du LIRMM depuis 2015.

Responsabilités en enseignement

  1. Directrice adjointe du département d'enseignement Informatique de la Faculté des Sciences de l'Université de Montpellier depuis 2015
  2. Directeur du pôle Informatique Transversale à Polytech de 2010 à 2015
  3. Responsable du parcours Bioinformatique, Connaissances et Données (BCD) du Master Sciences & Numériques pour la Santé (SNS) de 2012 à 2016
  4. Responsable du parcours Informatique Pour les Sciences du Master Informatique de 2011 à 2015
  5. Responsable de la cellule numérique de Polytech depuis 2015

Organisation congrès et conférences

  1. Mathematical and Computational Evolutionary Biology 2012-2017
  2. Workshop Colib'read, 7-8 novembre 2016 à Paris.
  3. France Génomique Workshop WetLab and Bioinformatics in Montpellier, 9-10th May 2016.
  4. Workshop international "Data Structures in Bioinformatics" Bielefeld, Allemagne, February 23-24, 2016.
  5. Colloque de Bioinformatique du GdR BIM, Paris, 2013 & 2015
  6. First international Workshop "Data Structures in Bioinformatics" Montpellier 8-9 Dec. 2014.
  7. Colloquium "Indexing for scientific big data", Paris 15th Jan 2014.
  8. Workshop international VARIAHTON 2013 Udine Italie, 21 May 2013.
  9. Workshop SeqBio, Montpellier, 2013 & 2014

Dernière mise à jour le 10/03/2017