- BioInformatique

La plateforme ATGC, labellisée par IBiSA en 2010, est soutenue par des Projets d'Investissement d'Avenir : l'IFB (Institut Français de Bioinformatique), France Génomique et le Labex NUMEV. La plateforme est adossée à l’équipe de recherche MAB (Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique) et bénéficie également des recherches réalisées au sein de l'IBC (Institut de Biologie Computationelle).

La plateforme a la triple vocation de diffuser les outils bioinformatiques développés au sein de la communauté montpelliéraine, de favoriser les collaborations entre partenaires informaticiens et biologistes, et d’apporter une aide à ces chercheurs en mettant en place des services bioinformatiques en lien direct avec leurs travaux.

Logiciels

Les outils qu’elle propose sont accessibles en ligne gratuitement.

Ils peuvent être téléchargés et/ou exécutés sur les clusters du LIRMM. Cette activité vise donc la communauté régionale, nationale et internationale. Les outils distribués sur ATGC ont une très grande visibilité internationale. Par exemple, le logiciel PhyML (développé au sein de l’équipe MAB, et classé « Current Classic » depuis Octobre 2007 par Science Watch) a été cité plus de 15 000 fois (cf. Web of Science).

Responsables

Responsable technique: Vincent LEFORT

Responsable scientifique: Eric RIVALS

La plateforme Bioinformatique est administrée par le service Réseaux du LIRMM.

Dernière mise à jour le 13/02/2018