" Duplication des gènes : impact sur l'évolution biologique des espèces et pour l'annotation fonctionnelle des génomes "

Pierre Pontarotti (Université de Provence - Marseille)

Plusieurs types de mutations peuvent survenir dans nos génomes, mutation ponctuelle, délétion , duplication, etc. Dans le cas d'une duplication la taille du duplicon (unité de duplication) peut aller d'un acide nucléique à un génome complet (polyploïdisation). Après l'événement de duplication plusieurs scénarii sont possibles :

1) La duplication n'est pas fixée dans les populations soit à cause de pression de sélection négatives ou par dérive génétique,

2) 2) la duplication est fixée (dans le cas d'une unité génique complète) les mécanismes sont les suivant : la première possibilité est que une des copie va garder sa « fonction » ancestrale et l'autre copie va évoluer vers une nouvelle « fonction » sous pression de sélection positive, la deuxième possibilité est que les deux copies soient « sous fonctionnalisée » une dernière possibilité est la dérive génétique.

Nous pouvons noter ici que l'utilisation du mot fonction est floue. C'est pour cette raison qu'une partie de ce séminaire sera consacrée à une précision sémantique du terme fonction. En effet la notion de fonction peut se voir à différent niveaux , moléculaire, cellulaire, de l'organisme. La mutation qui survient donc au niveau moléculaire peut avoir un impact a différents niveaux de ce qu'on appelle fonction.

Une notion importante, qui sera aussi développée, pour la compréhension de la « fonction » des gènes et l'apparition de nouvelles « fonctions » est la notion de co option ou recrutement.

Finalement, je montrerai comment ces concepts sont intgrés au laboaratoire dans une plateforme informatique dédiée à l'annotation automatique des génomes .