Le Département est structuré en douze équipes-projets.

• AlGco : Algorithmes, graphes et combinatoire
  
  Théorie des graphes : étude de problèmes algorithmiques et de structures combinatoires.
  
  Fiche résumé 2005-2008
  

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• ARITH : Arithmétique informatique
  
  Arithmétique, Algèbre linéaire, Cryptographie, Combinatoire énumérative, Combinatoire des mots, Dynamique symbolique, Géométrie discrète, Analyse d'images, Calcul formel, Calcul haute performance, Physique combinatoire et statistique, Réduction de réseaux.
  
  Fiche résumé ARITH 2011
  

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• Coconut : agents, apprentissage, contraintes
  
  Proposer et combiner des modèles et des algorithmes dans un contexte agents, apprentissage et contraintes
  
  Fiche résumé 2005-2008
  

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• DALI : Digits, architectures et Logiciels Informatiques
  
  L'équipe-projet DALI est l'unité de recherche en informatique commune à l'Université de Perpignan Via Domitia et au LIRMM. L'équipe-projet DALI, implantée à Perpignan sur le campus principal de l'UPVD, est membre du Département d'Informatique du LIRMM. Ses thèmes de recherche sont la haute performance et la précision des calculs sur ordinateurs.
  
  Fiche résumé DALI 2011
  

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• ESCAPE
  
  L'équipe Escape cherche à contribuer à l'étude des systèmes complexes à travers l'informatique théorique et ses modèles de calcul parallèle, plus spécifiquement les automates cellulaires et les pavages. Elle s'intéresse en particulier à la robustesse du calcul en présence d'erreurs, et aux aspects dynamiques et géométriques du calcul.
  

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• GraphIK : Représentation de connaissances et raisonnements
  
  Approche logique et à base de graphes, interrogation de bases de connaissances, aide à la décision basée sur des connaissances.
  

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• ICAR : Image & Interaction
  
  Traitement des données visuelles tels que les images, les vidéos et les objets 3D : codage et protection, analyse et traitement, modélisation et visualisation.
  
  Fiche résumé 2005-2008
  

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• MAB : Méthodes et algorithmes pour la bio informatique
  
  Analyse informatique des séquences génétiques, analyse statistique du transcriptome, reconstruction de l'évolution, génomique comparative et fonctionnelle, palud, HIV, cancer.
  
  Fiche résumé 2005-2008
  L'équipe MAB dans les actualités du CNRS
  

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• MAORE : Méthodes Algorithmes pour l'Ordonnancement et les Réseaux
  
  Conception et analyse de protocoles de réseaux : routage et diffusion de l'information, avec garanties de qualité de service.
  
  Fiche résumé 2005-2008 de l'équipe ex-APR
  

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• MAREL : Models And Reuse Engineering, Languages
  
  Génie logiciel et systèmes complexes : composants, objets, modélisation de systèmes complexes (chimie, biologie, robotique, information géographique).
  
  Fiche résumé 2005-2008
  

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• SMILE : Système Multi-agent, Interaction, Langage, Evolution
  
  Fiche résumé 2005-2008
  

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• TEXTE : Exploration et exploitation de données textuelles
  
  Analyse morpho-syntaxique et sémantique des langues : classification automatique de documents, recherche d'information, traduction automatique, pragmatique.
  
  Fiche résumé 2005-2008
  

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• TaToo : Extraction de connaissances dans les bases de données : motifs séquentiels et ontologies
  
  Fouille de données, Motifs séquentiels, Logique floue, Ontologie, Annotation automatique, Données multidimensionnelles
  
  Fiche résumé 2005-2008
  

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• ZENITH : Gestion de données scientifiques
  
  Intégration, analyse et traitement des données scientifiques à très grande échelle : gestion de données incertaines, gestion de workflows scientifiques, recherche d'information basée sur le contenu, systèmes pair-à-pair et cloud.
  

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