HIV-1 and HCV Molecular Epidemiology of a Libyan outbreak
Tulio de Oliveira
The South African National Bioinformatics Institute, Afrique du Sud
contact : tulio(at)sanbi.ac.za

Tulio de Oliveira présentera ses travaux, publiés dans Nature, qui ont contribué à innocenter les infirmières bulgares dans l'affaire de la contamination
des enfants Lybiens. Ceux-ci sont basés sur l'analyse phylogénétique des séquences du HIV prélevées chez les patients, et une approche Bayésienne issue de la génétique des populations et du modèle coalescent.

de Oliveira T, Pybus OG, Rambaut A, Salemi M, Cassol S, Ciccozzi M, Rezza G, Gattinara GC, D'Arrigo R, Amicosante M, Perrin L, Colizzi V, Perno CF; Benghazi Study Group.

In 1998, outbreaks of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) and hepatitis C virus (HCV) infection were reported in children attending Al-Fateh Hospital in Benghazi, Libya. Here we use molecular phylogenetic techniques to analyse new virus sequences from these outbreaks. We find that the HIV-1 and HCV strains were already circulating and prevalent in this hospital and its environs before the arrival in March 1998 of the foreign medical staff five Bulgarian nurses and a Palestinian doctor) who stand accused of transmitting the HIV strain to the children.