La biologie et ses applications, de la médecine à l’agronomie ou l’écologie, deviennent des sciences productrices des données massives et exigent des nouvelles approches computationnelles pour analyser et partager ces données.
Les nouvelles technologies de Séquençage à Haut Débit (SHD) apparues en 2005, et aussi appelées Séquençage de Nouvelle Génération (NGS), révolutionnent la manière dont sont posées et résolues les questions de recherches en science du vivant. Elles permettent aussi bien d'appréhender la diversité génomique au sein d'une espèce, que l'expression des gènes dans les cellules, ou les marques épigénétiques sur le génome. Les volumes de séquences amène ces sciences dans le domaine des « Big Data » et posent des challenges gigantesques pour l'exploitation de ces données.
Dans le domaine végétal, les méthodes de génétique quantitative permettent d’identifier les gènes impliqués dans des variations phénotypiques en réponse aux conditions environnementales. Elles produisent de grandes quantités de données à différents intervalles de temps (de minutes à des jours), sur différents sites et à différentes échelles depuis des échantillons de petits tissus jusqu’à la plante entière.
Ce workshop interdisciplinaire rassemblera les chercheurs impliqués dans les axes de recherche traitement de données, bioinformatique, echophysiologie, biologie, et d'autres, pour permettre d'approfondir les discussions concernant le traitement de données à grande échelle et divers aspects spécifiques au traitement de données pour la séquencage à haut débit et phenotypage végétal, etc, pour pouvoir identifier les perspectives de recherche pour 2013.

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Infos pratiques :

Vendredi 7 décembre 2012 de 9h à 17h

Lieu: Salle des séminaires, LIRMM, 161 rue Ada, 34095 Montpellier

Contacts: Esther.Pacitti@lirmm.fr et Eric.Rival@lirmm.fr

En savoir plus : http://www.lirmm.fr/~pacitti/Mastodons.html

Inscription gratuites (places limitées)
Date limite d'inscription: 30/11
Lien pour l'inscription: http://doodle.com/6c64axdvrf2cepiw