Publications
Liste complète de mes publications classées par type et par années décroissantes :
Articles dans revue
- [1] , Coralie Gallien, Bastien Boussau, Gergely J. Szollosi, Vincent Daubin et . Evolution of gene neighborhoods within reconciled phylogenies, Bioinformatics 28 (18): i382-i388. doi: 10.1093/bioinformatics/bts374, 2012.
Article : .pdf
- [2] Cédric Gaucherel, et François Munoz. Equation or algorithm: differences and choosing between them, Acta Biotheoretica. 59(1): 67-79, 2010.
Article : .pdf
- [3] , , , et . Computation of Perfect DCJ Rearrangement Scenarios with Linear and Circular Chromosomes, Journal of Computational biology (JCB), Volume 16, Number 10, pages 1287-1309, Mary-Ann Liebert Inc. publishers, 2009.
Article : .pdf
- [4] , et . SimCT: a generic tool to visualize ontology-based relationships for biological objects, Bioinformatics 25(23): 3197-3198, 2009.
Article : .pdf - Matériel supplémentaire : .pdf
- [5] , et . A more efficient algorithm for perfect sorting by reversals}, Information Processing Letters (IPL), Volume 106, Issue 3, 30 April 2008, Pages 90-95.
Article : .pdf
- [6] , , et . Perfect sorting by reversal is not always difficult}, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (TCBB), vol. 4, no 1, p 4-16, 2007.
Article : .pdf
- [7] , François Nicolas, Jérôme Buard, Olivier Gascuel et . A fast and specific alignment method for minisatellite maps, Evolutionary Bioinformatics Online (EBO) 2006:2 327-344/
Article : .ps, .pdf
- [8] et . Comparison of Minisatellites, Journal of Computational biology (JCB), 10(3-4), pages 357-72, Mary-Ann Liebert Inc. publishers, 2003.
Article : .ps, .pdf - Référence : .bib
Conférences internationales
- [1], Coralie Gallien, Bastien Boussau, Gergely J. Szollosi, Vincent Daubin et . Evolution of gene neighborhoods within reconciled phylogenies, 11th European Conference on Computational Biology (ECCB'12), 9-12 September 2012, Basel, Switzerland.
- [2] , , , et . Perfect DCJ rearrangement, 6th RECOMB Comparative Genomics
Satellite Workshop, 13-15 October 2008, Paris, France.
Article : .pdf
- [3] Cédric Gaucherel, François Munoz et . Equation against Algorithm: Which differences and which one to choose?, European conference on Computing And Philosophy (E-CAP 2008), 16-18 June 2008, Montpellier, France.
Article : .doc
- [4] , , et . Perfect sorting by reversal is not always difficult,
5th Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI05), 3-6 October 2005, Palma de Majorque.
Article : .pdf
- [5] , et . Conservation
of Combinatorial Structures in Evolution Scenarios,
2nd RECOMB Comparative Genomics Satellite Workshop (RGC), 16-19
October 2004, University of Bologna, Italy.
Series: Lecture Notes in Computer Science, Subseries: Lecture Notes in Bioinformatics, Vol. 3388, Pages 1-15. Lagergren, Jens (Ed.)
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- [6] et . Alignement de séquences avec
opérations non-commutatives, Actes des quatrièmes journées
francophones de recherche opérationnelle (FRANCORO IV), page 16, Fribourg, Suisse, 2004.
Résumé dans les actes - Référence : .bib
- [7] et . Comparison of Minisatellites, Proceedings of the Sixth Annual International Conference on Computational Biology (RECOMB02), pages 67-76, Washington, DC, USA, ACM press, 2002.
Article : .ps, .pdf - Présentation : .ps, .pdf - Référence : .bib
Conférences nationales
- [1] , et .
ClusterInspector SimCT, a tool to visualize ontology based relationships, Actes des Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM05), pages 447-457, Lyon, 2005.
Article : .pdf - Présentation : .pdf - Référence : .bib - Logiciel : SimCT
- [2] et . Comparaison de séquences avec amplifications et contractions, 5ème congrès de la société Française de Recherche Opérationnelle et d'Aide à la Décision (ROADEF'03), pages 169-170, Avignon, 2003.
Article : .ps, .pdf - Présentation : .ps, .pdf - Référence : .bib
- [3] et . Comparaison de minisatellites, Actes des Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM02), pages 261-262, Saint-Malo, 2002.
Article : .ps, .pdf - Présentation : .ps, .pdf - Référence : .bib
- [4] et . Comparaison de minisatellites, Actes de la 24ème réunion annuelle du Groupe de Génétique et Biologie des Populations (PPD), page 128, Montpellier, 2002.
Article : .ps, .pdf - Présentation : .ps, .pdf - Référence : .bib
Thèse
- [1] . Comparaison de séquences répétées en tandem et application à la génétique, Université Montpellier II, LIRMM, 2003.
Thèse : .ps, .pdf - Présentation : .pdf - Référence : .bib
Divers
- [1] . Alignement de séquences : application à la comparaison de chaînes d'ADN, Proceedings J'Docs 2003 XIèmes Journées des Doctorants, Université Montpellier II, 2003.
Article : .ps, .pdf - Présentation : .ps, .pdf
- [2] . Reconstruction d'histoire de répétitions en tandem, Rapport de DEA, Tuteur de stage : , Université Montpellier II, LIRMM, 2000.
Rapport : .ps
