Sujet proposés en 2013-2014

• Sujet de Thèse : Algorithmique pour l\'évolution des interactions géniques (Avec Vincent Berry et Sèverine Bérard)
• Sujets de Master 2 Recherche :
  • Algorithmique pour l\'évolution des interactions géniques (Avec Vincent Berry et Sèverine Bérard)
  • Heuristiques efficaces pour l\'échafaudage de génome (Avec Rodolphe Giroudeau)
  • Approche par contraintes pour l\'échafaudage de génomes avec répétitions (avec Rémi Coletta)
• Sujets de L3 ÉNSL
• Complexité et approximation sur le problème de l\'échafaudage de génomes
• Production de graphes d\'échafaudage à partir d\'une structure d\'indexation des k-mers pairés
• Sujets de L2 CMI :
  • Post-analyse de fichiers d\'alignement pour la construction de graphes d\'échafaudage
  • Implémentation efficace de l\'algorithme du blossom pour la recherche d\'un matching de poids maximal

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