Workshop Algorithmique, combinatoire du texte et applications en bio-informatique

Table of Contents

• 1 Programme

1 Programme

• Lundi 25 janvier accueil 9h30
  
• Lundi 10h00-12h30
  
  • Jean-Christophe Janodet. Apprentissage des boules de mots
  • Omar Ait Mous, Frédérique Bassino and Cyril Nicaud. Une construction linéaire de l'automate minimal de A*X quand X est fini
  • Gregory Nuel. On the first k moments of the random count of a pattern in a multi-states sequence generated by a Markov source
  • Mikaila Toko Worou and Jerome Galtier. Nouvelle Approche pour le Probleme de Modularite
• Lundi 14h00-16h00
  
  • Maxime Crochemore. Storing the past
  • Djamal Belazzougui. Succinct Dictionary Matching Without Slowdown
  • Martine Léonard, Laurent Mouchard and Mikaël Salson. Coût d'une mise à jour de la table des suffixes
• Lundi 16h40-18h30
  
  • Richard Groult, Elise Prieur and Gwénaël Richomme. Counting different palindromes in a word in linear time
  • Ferdinando Cicalese, Gabriele Fici and Zsuzsanna Lipták. Searching for jumbled patterns in strings
  • Discussion groupes de travail Comatege et Analyse de séquences
• Mardi 26 janvier accueil 8h15
  
• Mardi 8h30 - 9h50
  
  • Yassin Refahi. A Combinatorial Approach for Analyzing Perturbations in Phyllotaxis of Arabidopsis thaliana
  • Sébastien Angibaud, Guillaume Fertin, Annelyse Thévenin and Stéphane Vialette. Mesures de (dis)similarité entre deux génomes partiellement ordonnés par programmation linéaire
• Mardi 10h20 - 11h40
  
  • Azadeh Saffarian, Mathieu Giraud and Hélène Touzet. Locally optimal structures of an RNA
  • Cedric Saule, Mireille Regnier, Jean-Marc Steyaert and Alain Denise. Enumération de structures d'ARN avec pseudonoeuds
• Mardi 13h30 - 16h00
  
  • Laurent Noé, Marta Girdea and Gregory Kucherov. Seed design framework for mapping SOLiD reads
  • Eric Audemard, Thomas Faraut and Thomas Schiex. Détection de régions génomiques homologues par un algorithme de flot avec coûts
  • Mathieu Giraud, Stéphane Janot, Helene Touzet and Jean-Stéphane Varré. Processeurs massivement multi-coeurs et analyses de séquences
  • Raluca Uricaru and Eric Rivals. Trapezoid graphs, independent sets, and whole genome comparisons

Author: Eric Rivals <rivals_AT_lirmm.fr>

Date: 2010/01/13 21:55:49