Protein PFL1705w (PlasmoDB link) - New domain zf-CCCH (Pfam link)

Sequence and domain localizations (colored) at: 424...449

   1 MRRGLGNEKRFLRRSFNRSYYYKKNEKEKIEEMNSRKNNNYEKEEEEDDEEDIDGVDEDI   60
  61 KEKCSKAVCDMNSSDIEERNEKKKKNEKFIVKEKKELSVNDESFLIKNMEQNNNDKGQDK  120
 121 NNVICPLCVEVLDETDRNFFPCDCGYQICLWCLYYIRDHMNNTCPACRRSYEEKNFIYNK  180
 181 ETHEKLIKKQKSNKNKSDNNNNNNNNNNNINRGDNNYMNNINLTNMNEMNNINDMNNINN  240
 241 NNNDDNNNNNDNNNNDNNNDNDNNNDNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNYYYYISNNYNNN  300
 301 YSSSGSLLYRSDTYKHPNIYNIHEYDNLLEIIKSIRVVQRNLVFVIGITATYAKKTVLKK  360
 361 NEHFGKYGKILNIIINKSQAYNPQYNGPSFSAYITYSNEKEAINAIYFIDGMTLDNKILK  420
 421 ASFGTTKYCSSFLKNASCGNEECFYLHELGNVIDSFSKDDIHGPKHIYHDLLYLYFKKLP  480
 481 DKKNDGTYDSLSNSITIKNFKLNEEDVSSLVKIEKTETKKKLENNIEDTNVNDDIKKNNN  540
 541 INYTEFKYFNEWKNKNLNLEKIKQDQNKNAPPQNNKQSKWIMEDKILQIKKSATHDNIPI  600
 601 QSNDQENYDIDDDIHDNDINDMDDVDDKKSNNNNKIKAKKKKKSKSEDVLPLDMLKNNSY  660
 661 IATNKNNIPTNDKKGKNYLNSVQNTSTSLIFNSYSDDKDHISKNKNNNTSKNNNNNNNNN  720
 721 NVMNDTDYLNELSENYPSINEALLDKDKKKKAKKKAEKNKAEKNKAEKNKAEKNKAEKNK  780
 781 AEKNKAEKNKAEINKTDTNKENTNNEDKNNEDKNNEDKNNEDKNNEEDRNKIITKNESEE  840
 841 QKKENDSTDTKKNKKKNQNNQLIENKKKEQDNINKNNITNNKQESNNINEKSTDDSKKFT  900
 901 SLISNYFSELLDKKKKKDTSKNETQEKNEEINKENVIDKKKNKNTQPQHVIIFNNNNDNY  960
 961 NNNNNNNNNSNIIIGFREGQVELARRKEFIFTDDGKIKKIVEEKDKLEGKSKEDKKGDQQ 1020
1021 SDVHQIIDKKQGGIENQSLEESKRKAKNIQQKDNTKNAELLKCDEKKTEGNLSNTLTHYV 1080
1081 TNQQDNFDQDIENNIHNQNEENNLNKNTSKGKKKIENNNKVVDTKILNIEDIIKMKSINN 1140
1141 NDNIKLPEEIKEYIKKMKSGGIKENVEYDIYHKFINNYFNVKEYVDGIIVVEEKEVKAMK 1200
1201 GNDNNVKDQKKGKHEEDNKKKVLISKTEEGDTSKRKQKNMSDKKNKKEKRKKKKDKKNDN 1260
1261 DNEEENDNEEDQEEDEKQDIINKDGILQKENKKIKNKNKTKKKNDQEEKEEEDEDDEDEE 1320
1321 DDDEEEEEEIQKDNVTLIKKKKKKKEKKNISNKKNVMYHKEMEGYIMDTIMGIILNELKG 1380
1381 KNNVKQININKNNYDDEKNVLLKDVEIFIKNLCVAKCKSIENNKNKENILYIIEEGNDEN 1440
1441 NTSKKKEAKKKAKRNDYIIYSNDEHTFLKSHKGIMQYILKNGNTSSNKNNKIKNVDDKNN 1500
1501 NVDDKNNNVDDKNNNVDDKNKNVGDKNKNGDDKNKNVGDSNKAKIKISEYLNDKNTFDFF 1560
1561 KDLIISNNQDTIHTPDHIIFDKIFNEQINFVQQLCETDFKINSRNVISTNKKTDRHLYQS 1620
1621 NQNVHNKLKKNTQGGGNISNIWVNFDNTVQNKELNEKLNLSA 1662

Alignement of domain consensus (first line) on the sequence (colored line).

Each position reports the amino acid with highest probability; capital letters mean highly conserved residues (i.e. with probability > 50%).

Occurence 424...449
  1 yktelCrffsrtGtCkydrCkFaHge  26
424 GTTKYCSSFLKNASCGNEECFYLHEL 449