Protein PVX_100525 (PlasmoDB link) - New domain DEAD (Pfam link)

Sequence and domain localizations (colored) at: 304...460 

  1 MRRARMREKAEAHKRPIEFEDDETKKKIRTEDEESVKDARGGENVSPLLPEQQKGRNKNL  60
 61 KNDAEYIEFLKKEARRKYLKEREREKLDVTKKLLDDELLYSTIKLEGKELKELELSKRIY 120
121 DIAKENIKLREKLKENYYLFQEDFDKVDASNKGADADAAQVREGKGDPSAYNYDEQIISK 180
181 GILKFGSGVPISEGIKNDFVFEDDLANRKSAKREECEKHKYEREKERKKKKKRRSDSGSA 240
241 VGSKRNGKGLTDVVEFVHLESLYGMDEKEKELQRLFEDIKRKKEKKMKKIIDDRKRLPIY 300
301 SYRYDILKAIKNNKILILVGETGSGKSTQLTQYLHECKYHLYGNIVCTQPRRIACIAIAN 360
361 RVADEMNVRVGKEVGYVIRFQNKTSDSTKIVYMTDGMFLRLLLYNPTLDDISVLIIDEAH 420
421 ERALHTDVILPIIKDICNFREDIRVIISSATLDAEKISTYFNCAPIFYVPGRKYNVDIYY 480
481 TINNESNYLSAIVITILQIHVTQEKGDILVFLPGQFEIELVQQELENKLGELAPRFRNMM 540
541 VLPIYSSLPVEQQARIFEDVADEDNAKGDAPEGGDGGAPGEAEKIEAAQCEAANLEAAQP 600
601 GELAPASQPKRTMRRGTRKIILSTNICETSITIDNIVYVIDSGLCKQKVYNPNSGVESLV 660
661 TLPCSKASVNQRTGRAGRKQDGKCFRLFTKKSFIDLNDNSVPEIQRCEVSSMILLLKSLG 720
721 MDDIINFDFLDPPSPVVIIKGLELLYSLGALNDEGNLTKTGRKMAEFPTDVKSSKMILSA 780
781 SDKYNCVEEVLCITAMLTHANSIFYVQKGKEKEAENVKKMFTIEGGGDFLLLLNIYKQCE 840
841 ENNFSTSFCYDHFLQYHTMIKIKDIKTQLVSICEKIDLPSSSCGIQNHEAICSLKKCIVS 900
901 AFFTNAALPVSKNELKIIKLNHVVSIYPNSVLAKKNIMEEYKNACIIFYEVIKINKSYVR 960
961 HNIPVSKDMLYEIASFYFLGKIA 983

Alignement of domain consensus (first line) on the sequence (colored line).

Each position reports the amino acid with highest probability; capital letters mean highly conserved residues (i.e. with probability > 50%).

Occurence 304...460 
  1 tpiipaileGrDvlvqApTGSGKTlAfllPileallk.ppqalvlaPTReLaeQiyeelk  59
304 YDILKAIKNNKILILVGETGSGKSTQLTQYLHECKYHlYGNIVCTQPRRIACIAIANRVA 363

 61 klgkgllglkvallyGGdsikeqrpdIlvgTPgrLldllld...lknlkllVlDEAdrll 119
364 DEMNVRVGKEVGYVIRFQNKTSDSTKIVYMTDGMFLRLLLYnptLDDISVLIIDEAHERA 423

121 mfgddleeilrrl...ppkrqtllfSATlp.rnvedl 157
424 LHTDVILPIIKDIcnfREDIRVIISSATLDaEKISTY 460