Copyright Dorian Kauffmann CNRS France BioImaging
L’équipe ICAR du LIRMM est impliquée dans la publication de Light My Cells, une base de données ouverte d’envergure décrite dans la revue Scientific Data. Cette ressource structurante vise à accélérer le développement de méthodes d’intelligence artificielle capables de prédire des images de fluorescence à partir d’images en lumière transmise, ouvrant la voie à des approches de microscopie moins invasives.
La microscopie de fluorescence constitue aujourd’hui un outil essentiel pour l’observation de structures cellulaires, mais elle repose sur des marquages souvent contraignants. En proposant une alternative basée sur le « marquage in silico », Light My Cells contribue à lever ces limitations en s’appuyant sur des techniques avancées d’apprentissage automatique.
Développée dans le cadre de l’infrastructure nationale France-BioImaging, cette base rassemble 2 574 acquisitions, soit près de 57 000 images 2D, issues de 30 études conduites dans 8 centres d’imagerie. Par la richesse et la diversité des données proposées, elle constitue un socle de référence pour l’entraînement, l’évaluation et la comparaison de nouvelles approches en imagerie bio-médicale.
Au LIRMM, ces travaux ont été menés par Dorian Kauffmann, sous la supervision d’Emmanuel Faure et Guillaume Gay, au sein de l’équipe ICAR, en collaboration avec un large consortium national.
Avec Light My Cells, le LIRMM confirme son engagement dans le développement de méthodes innovantes à l’interface entre intelligence artificielle et imagerie biologique, au service de la compréhension du vivant.
PLUS DE DETAILS : https://www.ebi.ac.uk/biostudies/BioImages/studies/S-BIAD1047
CONTACT : Emmanuel FAURE
