MAB: Méthodes et algorithmes pour la bio informatique

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À la croisée de la biologie et de l’informatique, la bioinformatique cherche à résoudre des questions biologiques par le calcul. Celles-ci couvrent un large spectre, de la biologie fondamentale à l’agronomie en passant par la santé et l’environnement. L’équipe MAB poursuit des travaux méthodologiques (algorithmique du texte et des arbres, combinatoire, optimisation, modélisation probabiliste, apprentissage statistique) pour répondre à des questions biologiques essentielles (évolution, phylogénie, génomique comparative, annotation fonctionnelle des gènes et des protéines, paludisme, HIV, cancer).

Les thématiques de recherche sont organisées en trois axes : Algorithmique du texte et méthodes pour l'analyse du séquençage à haut débit, Méthodes pour l’inférence évolutive, et Outils pour l’annotation fonctionnelle. Les logiciels développés dans l'équipe sont disponibles sur la plateforme ATGC.

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Actualités

Novembre 2017 : Soutenance de le thèse d'Emma Saulnier : "Phylodynamique des pathogènes viraux par calcul bayésien approché". Félicitations Emma !

Novembre 2017 : Olivier Gascuel reçoit le "Grand Prix INRIA Académie des Sciences". Félicitations Olivier !

Mots-clés

Algorithmique du texte et des arbres, Combinatoire, Optimisation, Modélisation probabiliste et statistique, Classification, Phylogénie, Séquençage haut debit, Génomes, Transcriptomes, Protéomes, Cancer, Paludisme, VIH

Dernière mise à jour le 29/11/2017